MicrobioSee: 基于Web的微生物学多组学可视化工具

随着高通量测序技术的升级和发展，可以低成本获得多组学数据。然而，用于微生物多组学数据分析的绘图工具无法满足数据描述的需求，并导致实验生物学领域研究人员的高学习成本，复杂的依赖性和高费用。因此，为多组学数据开发工具包对于微生物学家节省精力至关重要。在这项工作中，我们开发了MicrobioSee，这是一种基于网络技术的实时交互式可视化工具，可以可视化微生物多组学数据。它包括围绕微生物的主要组学数据的17个模块，例如转录组，宏基因组和蛋白质组。使用MicrobioSee，绘图方法在多组学研究中得到了简化，例如多样性，ROC和DEG富集途径的可视化。随后，选取了3个案例研究来代表微生物学检测的功能应用。总体而言，我们为研究人员提供了一个简洁的工具包以及用户友好，省时，跨平台和源打开，特别是没有编码经验的微生物学家。在 https://microbiosee.gxu.edu.cn 免费提供。